רפואה נתמכת ראיות

סטטיסטיקה מרפאת 84- קיטוע סדרת מדידות- השיטה ושכלולים

Impact of changes to national guidelines on hypertension-related workload: an interrupted time series analysis in English primary care
 
השיטה הסטטיסטית בקיטוע סדרת מדידות דומה מאוד לשיטה ברגרסיה לינארית פשוטה. למרות שהמשתנה הבלתי תלוי שמעניין אותנו הוא ההתערבות שקרתה בזמן מסויים, הזמן הוא המשתנה הבלתי תלוי שסביבו הנוסחה בנויה. לפני ההתערבות ישנו קבוע שאומר מה הייתה המדידה בתחילת המעקב ומקדם שאומר מהו קצב השינוי, זאת אומרת בכמה המדידה השתנתה עבור כל יחידת זמן. בנוסחה מופיע גם משתנה קטגוריאלי עם שני ערכים אפשריים: האם מדובר בזמן שלפני או אחרי ההתערבות. אם מדובר בזמן שאחרי ההתערבות מתווספים שני שינויים אפשריים: ברמת המדידה ובמגמה לאורך זמן.  
שכלולים אפשריים לשיטה הם שיכוב לפי משתנה מסביר נוסף (למשל, שכבות גיל), השוואה בין הצפוי לפי המגמה הקודמת לבין מה שקרה בפועל לאחר ההתערבות, ושימוש ב negative control  (משתנה תלוי שלא אמור להיות מושפע מההתערבות)
Interrupted time series analysis
Segmented regression model
Change in level
Change in trend
Negative control
Stratification

סטטיסטיקה מרפאת 83- קיטוע סדרת מדידות- סוג המשתנים

Impact of changes to national guidelines on hypertension-related workload: an interrupted time series analysis in English primary care
Survival after Minimally Invasive Radical Hysterectomy for Early-Stage Cervical Cancer
בקיטוע סדרת מדידות נמדדת השפעת משתנה בלתי תלוי קטגוריאלי (דיכוטומי) על משתנה תלוי כמותי או קטגוריאלי. המשתנה הקטגוריאלי הוא החשיפה או ההתערבות. למשל, ללא קווים מנחים חדשים לפני האירוע ועם קווים מנחים אחריו. המשתנה התלוי,  גם אם החל כקטגוריאלי, מקבל תמיד צורה כמותית כדי לבחון את מגמת ההשתנות לאורך זמן.
הזמן עצמו הוא משתנה בלתי תלוי נוסף, שגם הוא משפיע על התוצא, אך צריך לזכור שמדובר רק במשתנה עזר.
הזמן קשור גם למשתנה התלוי, כיוון שנבדקת השפעה גם על המגמה, ושמגמה (trend) היא שינוי לאורך זמן.
Interrupted time series analysis
Trend
Independent variable
Dependent variable 
Time as an independent variable

סטטיסטיקה מרפאת 82- קיטוע סדרת מדידות- התנאים

Impact of changes to national guidelines on hypertension-related workload: an interrupted time series analysis in English primary care
מאמר הסבר מצויין על השיטה
 
כדי לבצע קיטוע סדרת מדידות, ההתערבות צריכה להיות מוגדרת היטב בזמן, התוצא צריך להיות כזה שמופיע זמן קצר (או לפחות זמן ידוע) לאחר ההתערבות, וצריך כמות מספיקה של מדידות לפני ואחרי ההתערבות כדי לאפשר דיוק ואמינות וכדי למנוע הטיה שנובעת מעונתיות של תוצאות- למשל, מהעובדה שדלקת ריאות שכיחה יותר בחורף. למרות הרצון לכלול כמה שיותר מדידות, לעתים נרצה להגביל את תקופת המדידות לפני ההתערבות או אחריה, כדי לא לכלול בתקופת המדידות אירוע "זר" שיכול להשפיע על התוצא.
Time series analysis
Interrupted time series analysis
Intervention/Outcome characteristics allowing time series analysis
Seasonality
Bias
 

סטטיסטיקה מרפאת 81- קיטוע סדרת מדידות- מתי ולמה

Rates of Induction of Labor at 39 Weeks and Cesarean Delivery Following Publication of the ARRIVE Trial
Survival after Minimally Invasive Radical Hysterectomy for Early-Stage Cervical Cancer
מחקר מבוקר אקראי שפורסם בהמשך:
LACC Trial: Final Analysis on Overall Survival Comparing Open Versus Minimally Invasive Radical Hysterectomy for Early-Stage Cervical Cancer
מחקר ה arrive:
Labor Induction versus Expectant Management in Low-Risk Nulliparous Women
 
Interrupted time series analysis
או בחידוש שלי- קיטוע סדרת מדידות, היא שיטה סטטיסטית המשתמשת בניסוי טבעי. אירוע מסויים הגורם לשינוי בטיפול או בחשיפה, ושימוש במדידות חוזרות של משתנה מסוים לפני ואחרי אותו אירוע. לאחר האירוע נבדקים שני השפעות אפשריות: הראשונה- השפעה מיידית על ערך המשתנה הנמדד, והשנייה- השפעה על הטרנד, מגמת ההשתנות לאורך זמן. המדידות החוזרות שלפני האירוע מאפשרות לזהות מגמת שינוי שאינה קשורה לאירוע המדובר, והשינוי במגמה לאחר האירוע יכול להיות מיוחס לאירוע עצמו.
Time series analysis
Interrupted time series analysis
Level
Treand
Change in level
Change in trend

סטטיסטיקה מרפאת 80- רווח בר סמך ברגרסיית קוקס

Neoadjuvant FOLFIRINOX versus upfront surgery for resectable pancreatic head cancer (NORPACT-1): a multicentre, randomised, phase 2 trial
 
כיוון שבתוך רגרסיית קוקס כלולה למעשה רגרסיה לינארית*, אפשר לבנות רווח בר סמך למקדם בתוך אותה רגרסיה לינארית. ובדיוק כפי שאפשר לתרגם את המקדם ל hazard ratio, גם את אותו רווח בר סמך למקדם אפשר לתרגם לרווח בר סמך עבור ה hazard ratio. כאשר רווח בר סמך ל hazard ratio כולל בתוכו את הערך 1, התוצאה אינה מובהקת.
*(בתוך הנוסחה יש חזקה, והרגרסיה הלינארית היא המעריך בחזקה זו)
Cox regression inference
Confidence interval for hazard ratio

סטטיסטיקה מרפאת 79- רווח בר סמך למקדם הרגרסיה הלינארית

Antiepileptic Drug Exposure in Infants of Breastfeeding Mothers With Epilepsy
 
המקדם עבור משתנה מסביר ברגרסיה הלינארית מציין שיפוע של קו. זהו הקו המתאר את הקשר בינו לבין המשתנה החזוי. בעזרת השאריות סביב קו זה אפשר לחשב את סטיית התקן לשיפוע הקו. מתוך סטיית תקן זו, מחושבת שגיאת תקן ובעזרתה אפשר לבנות רווח בר סמך. רווח בר סמך זה הוא עבור שיפוע הקו, זאת אומרת עבור המקדם בנוסחת הרגרסיה הלינארית. כאשר רווח בר סמך כולל את הערך 0, התוצאה אינה מובהקת, כיוון ששיפוע 0 מייצג העדר קשר בין המשתנה המסביר למשתנה החזוי.
Linear regression
Inference in linear regression
Confidence interval for the regression coefficient
Statistical significance

סטטיסטיקה מרפאת 78- log rank test

Neoadjuvant FOLFIRINOX versus upfront surgery for resectable pancreatic head cancer (NORPACT-1): a multicentre, randomised, phase 2 trial
מבחן הלוג-ראנק עוזר כאשר יש שתי קבוצות ולכל אחת מהן עקומת קפלן מאייר. המבחן בודק האם כאשר השערת האפס נכונה, סביר לקבל הבדל בין העקומות כפי שהתקבל במחקר.
השיטה של המבחן מאוד דומה למבחן חי בריבוע, ומתבססת על הפער בין הצפוי (בנוכחות השערת האפס) למה שהתקבל בפועל במחקר. אך בניגוד לחי בריבוע הרגיל, כאן הפער מחושב פעמים רבות (עבור נקודות זמן מרובות). מספר האירועים הצפוי בנקודת זמן מסוימת נובע מחלוקה של האירועים בין שתי הקבוצות באופן יחסי לגודלן. במלים אחרות, כמות האירועים הצפוייה בכל קבוצה תלויה בכמות האנשים בסיכון בכל נקודות זמן. הפער מתוקנן לכמות האירועים הצפויה בכל קבוצה. 
ככל שהפער בין הצפוי בנוכחות השערת האפס למה שהתקבל בפועל יותר גדול, כך יתקבל במבחן הזה ערך גדול יותר, וערך ה p יהיה קטן יותר.
Log rank test
Kaplan-meier curves
Statistical inference

סטטיסטיקה מרפאת 77- האמת המפתיעה על רגרסיות

Neoadjuvant FOLFIRINOX versus upfront surgery for resectable pancreatic head cancer (NORPACT-1): a multicentre, randomised, phase 2 trial
למרות שמדובר בטכניקות מורכבות, גם הרגרסיות וגם עקומת קפלן מאייר הן רק סטטיסטיקה תיאורית. הן מספרות לנו משהו על המדגם במחקר מסוים, אך אינן מספיקות כדי להסיק מתוכן על המציאות, האמת שמחוץ למחקר. כדי להסיק על המציאות ניתן להשתמש ברווח ברך סמך (עבור מקדמי רגרסיות, למשל) ובמבחנים סטטיסטיים (להשוואה בין שתי עקומות קפלן-מאייר, למשל)
 
Kaplan-meier curves
Cox regression
Statistical inference in regressions
Statistical test
Confidence interval

סטטיסטיקה מרפאת 76- נוסחת רגרסיית קוקס

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality
התוסף של המאמר
נוסחת רגרסיית קוקס דומה מאוד לנוסחת הרגרסיה הלוגיסטית. בשני המקרים מדובר בחזקה, במספר אוילר (e) בבסיס, ובמעריך שבו רצף דומה מאוד לנוסחת הרגרסיה הלינארית: מכפלות המחוברות אחת לשנייה. כל מכפלה היא מקדם מסוים כפול משתנה מסויים, למשל המקדם 0.48 כפול לחץ הדם הסיסטולי. כדי לתרגם מקדם ל HR (hazard ratio), אפשר פשוט להציב אותו כמעריך של מספר אוילר (e). למשל, כאשר מספר אוילר מועלה בחזקת 0.48, מקבלים HR של 1.58, וזוהי הייתה אכן התוצאה שפורסמה במחקר ושהתקבלה מתוך רגרסיית קוקס שכללה גם משתנים אחרים. ה HR  לתמותה כללית היה 1.58 עבור כל עליה של סטיית תקן אחת (14 ממ כספית) בלחץ הדם הביתי. (רווח בר סמך: 1.56-1.60)
Cox regression formula
Cox regression coefficients
Hazard ratio- HR
Translation from coefficients to HR
 

סטטיסטיקה מרפאת 75- רגרסיית קוקס- למה?

Relationship between Clinic and Ambulatory Blood-Pressure Measurements and Mortality
התוסף של המאמר
 
יש שתי סיבות עקריות להשתמש ברגרסיית קוקס ולא בעקומות קפלן מאייר. אחת- כאשר המשתנה המסביר הוא כמותי (ולא קטגוריאלי עם שתי קבוצות בלבד). השנייה, חשובה יותר, היא כיוון שכך ניתן לקחת בחשבון מאפיינים נוספים מרובים של המטופלים, ולנטרל ערפלנים.
Cox regression
Multivariate analysis
Adjustment for confounders
Prediction
Kaplan-Meier method